Шопаев Амангельды внес вклад в лечение острых кишечных инфекций, вопросы вакцинопрофилактики детей, классификацию и лечение больных бронхолегочной патологии.

Опубликовано 33 научных статей из них 2 материала международной конференции, 7 рационализаторских предложений.